El laboratorio dirigido por Xosé Bustelo del Centro de Investigación del Cáncer de Salamanca (CIC, instituto mixto de la Universidad de Salamanca y el CSIC), del Centro de Investigación Biomédica en Red de Cáncer y de la Conexión Cáncer del CSIC, ha publicado una nueva herramienta informática, que han denominado CiberAMP, que permite establecer, por primera vez, correlaciones directas entre cambios en el número de copias de genes que tienen lugar en las células tumorales y los niveles de expresión de estos.
A través de esta herramienta, desarrollada en el Centro de Investigación del Cáncer (USAL-CSIC), se pueden identificar alteraciones genéticas que tienen un papel directo en el desarrollo del cáncer. Utilizando datos genómicos derivados de pacientes con un cáncer de cerebro conocido por glioblastoma, el uso de esta herramienta ha permitido descubrir nuevos genes potencialmente implicados en el desarrollo de este tumor
Como apunta Rubén Caloto, el autor principal de este trabajo, «esta nueva herramienta, que es de fácil utilización por cualquier usuario sin necesidad de tener grandes conocimientos de informática, nos da información sobre el grado de correlación entre el cambio del número de copias de genes y sus niveles de expresión utilizando los datos genómicos disponibles para 33 tipos de tumores diferentes obtenidos tras el estudio de más de 11.000 pacientes. Además, nos permite saber el contexto genómico de estas alteraciones genéticas, lo que nos da una información muy valiosa para saber si estos genes alterados tienen funciones importantes en el desarrollo de estos tumores. Y es también muy flexible, puesto que con ella podemos estudiar un gen concreto en un tumor concreto o, alternativamente, miles de genes en cualquier tumor o grupo de tumores que queramos».
